ЗАО «ФармФирма «Сотекс» – основа производственного сегмента ГК «ПРОТЕК» и одно из наиболее современных и высокотехнологичных фармацевтических предприятий России.  На заводе «Сотекса» в Сергиево-Посадском районе Московской области осуществляется полный цикл производства лекарственных средств, в том числе биотехнологических препаратов. Компания «Сотекс» имеет сертификаты GMP, выданные уполномоченными регуляторными органами РФ и ЕС. Портфель компании включает более 150 наименований лекарственных средств, включая оригинальные препараты. Основные терапевтические направления: неврология, онкология, ревматология, нефрология, противопростудные препараты и др.

В 2017 году ГК «ПРОТЕК» завершила сделку по покупке фармацевтического завода АО «Рафарма» и значительно усилила свой производственный потенциал. АО «Рафарма» – современный многопрофильный фармацевтический комплекс. Завод «Рафармы» в Липецкой области – это пять отдельно стоящих цехов с изолированными системами водо- и воздухоподготовки, рассчитанных на производство лекарственных средств по полному циклу в соответствии со стандартами надлежащей производственной практики.